MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. Cc (Cinara cedri)

Total Repeats: 17523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008513	T	7	7	4	10	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
2	NC_008513	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
3	NC_008513	ATTA	2	8	99	106	50 %	50 %	0 %	0 %	116514951
4	NC_008513	A	6	6	110	115	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
5	NC_008513	AGG	2	6	153	158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514951
6	NC_008513	GGT	2	6	199	204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514951
7	NC_008513	ATT	2	6	224	229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
8	NC_008513	A	7	7	314	320	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
9	NC_008513	ATT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
10	NC_008513	T	6	6	330	335	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
11	NC_008513	A	7	7	344	350	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
12	NC_008513	AAG	2	6	368	373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
13	NC_008513	ATA	2	6	382	387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
14	NC_008513	ATT	2	6	412	417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
15	NC_008513	CTG	2	6	461	466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	116514951
16	NC_008513	TGG	2	6	513	518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	116514951
17	NC_008513	AAG	2	6	519	524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
18	NC_008513	ATG	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
19	NC_008513	A	7	7	561	567	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
20	NC_008513	ACC	2	6	603	608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	116514951
21	NC_008513	A	11	11	615	625	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
22	NC_008513	A	7	7	645	651	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
23	NC_008513	T	6	6	677	682	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
24	NC_008513	T	6	6	684	689	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
25	NC_008513	AAC	2	6	701	706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	116514951
26	NC_008513	ATT	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
27	NC_008513	A	8	8	766	773	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
28	NC_008513	TA	3	6	791	796	50 %	50 %	0 %	0 %	116514951
29	NC_008513	AAT	2	6	849	854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
30	NC_008513	TCA	2	6	876	881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
31	NC_008513	ATT	2	6	916	921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
32	NC_008513	CTA	2	6	938	943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
33	NC_008513	CAAT	2	8	976	983	50 %	25 %	0 %	25 %	116514951
34	NC_008513	ATT	2	6	1037	1042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
35	NC_008513	A	8	8	1077	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
36	NC_008513	TTAT	2	8	1093	1100	25 %	75 %	0 %	0 %	116514951
37	NC_008513	ACT	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
38	NC_008513	GAA	2	6	1132	1137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
39	NC_008513	TGA	2	6	1242	1247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
40	NC_008513	GTA	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
41	NC_008513	ATT	3	9	1308	1316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
42	NC_008513	TGA	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
43	NC_008513	ACT	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514951
44	NC_008513	GAT	2	6	1375	1380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514951
45	NC_008513	T	6	6	1394	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
46	NC_008513	A	6	6	1402	1407	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
47	NC_008513	A	6	6	1440	1445	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
48	NC_008513	TAT	2	6	1446	1451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
49	NC_008513	T	9	9	1469	1477	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
50	NC_008513	TAA	3	9	1482	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514951
51	NC_008513	A	7	7	1489	1495	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
52	NC_008513	AT	3	6	1498	1503	50 %	50 %	0 %	0 %	116514951
53	NC_008513	A	10	10	1506	1515	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
54	NC_008513	T	6	6	1584	1589	0 %	100 %	0 %	0 %	116514951
55	NC_008513	A	11	11	1590	1600	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
56	NC_008513	TTA	2	6	1604	1609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
57	NC_008513	GAA	2	6	1627	1632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514951
58	NC_008513	AT	3	6	1659	1664	50 %	50 %	0 %	0 %	116514951
59	NC_008513	AAGAAA	2	12	1673	1684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	116514951
60	NC_008513	A	7	7	1686	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
61	NC_008513	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
62	NC_008513	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
63	NC_008513	TAAA	2	8	1778	1785	75 %	25 %	0 %	0 %	116514951
64	NC_008513	ATT	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514951
65	NC_008513	A	8	8	1866	1873	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
66	NC_008513	A	12	12	1875	1886	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
67	NC_008513	TTTTA	2	10	1888	1897	20 %	80 %	0 %	0 %	116514951
68	NC_008513	A	6	6	1897	1902	100 %	0 %	0 %	0 %	116514951
69	NC_008513	ATTTT	2	10	1908	1917	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008513	T	6	6	1921	1926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_008513	T	6	6	1975	1980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_008513	T	6	6	1994	1999	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
73	NC_008513	T	8	8	2012	2019	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
74	NC_008513	TCT	2	6	2029	2034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
75	NC_008513	CTA	2	6	2040	2045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
76	NC_008513	AAT	2	6	2066	2071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
77	NC_008513	CGG	2	6	2076	2081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	116514952
78	NC_008513	CAT	2	6	2088	2093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
79	NC_008513	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	116514952
80	NC_008513	GTTT	2	8	2203	2210	0 %	75 %	25 %	0 %	116514952
81	NC_008513	TAAT	2	8	2214	2221	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
82	NC_008513	TAA	2	6	2226	2231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
83	NC_008513	TAT	2	6	2241	2246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
84	NC_008513	T	6	6	2257	2262	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
85	NC_008513	ATT	2	6	2263	2268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
86	NC_008513	TA	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
87	NC_008513	A	6	6	2297	2302	100 %	0 %	0 %	0 %	116514952
88	NC_008513	TAA	2	6	2322	2327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
89	NC_008513	T	6	6	2329	2334	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
90	NC_008513	T	7	7	2338	2344	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
91	NC_008513	TAA	2	6	2347	2352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
92	NC_008513	T	6	6	2360	2365	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
93	NC_008513	GAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	116514952
94	NC_008513	ATT	3	9	2383	2391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
95	NC_008513	ACT	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	116514952
96	NC_008513	T	7	7	2420	2426	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
97	NC_008513	T	9	9	2429	2437	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
98	NC_008513	AT	3	6	2449	2454	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
99	NC_008513	T	10	10	2456	2465	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
100	NC_008513	T	8	8	2467	2474	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
101	NC_008513	T	6	6	2480	2485	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
102	NC_008513	TAA	2	6	2488	2493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
103	NC_008513	T	6	6	2504	2509	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
104	NC_008513	T	10	10	2516	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
105	NC_008513	T	6	6	2531	2536	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
106	NC_008513	TA	3	6	2545	2550	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
107	NC_008513	ATT	2	6	2555	2560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
108	NC_008513	TAT	2	6	2578	2583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
109	NC_008513	AT	3	6	2582	2587	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
110	NC_008513	T	10	10	2587	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
111	NC_008513	AAT	2	6	2600	2605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
112	NC_008513	TTA	2	6	2606	2611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
113	NC_008513	TAT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
114	NC_008513	ATT	2	6	2630	2635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
115	NC_008513	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
116	NC_008513	T	8	8	2653	2660	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
117	NC_008513	TTTTA	2	10	2665	2674	20 %	80 %	0 %	0 %	116514952
118	NC_008513	TA	3	6	2673	2678	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
119	NC_008513	T	8	8	2689	2696	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
120	NC_008513	ATTGAT	2	12	2703	2714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	116514952
121	NC_008513	TA	3	6	2718	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
122	NC_008513	T	7	7	2752	2758	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
123	NC_008513	CTT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
124	NC_008513	TA	3	6	2772	2777	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
125	NC_008513	AGG	2	6	2779	2784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	116514952
126	NC_008513	AT	4	8	2792	2799	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
127	NC_008513	T	7	7	2806	2812	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
128	NC_008513	A	9	9	2833	2841	100 %	0 %	0 %	0 %	116514952
129	NC_008513	TAA	3	9	2845	2853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	116514952
130	NC_008513	ATT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
131	NC_008513	T	6	6	2917	2922	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
132	NC_008513	TTC	2	6	2932	2937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
133	NC_008513	TTA	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	116514952
134	NC_008513	AGA	2	6	2983	2988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	116514952
135	NC_008513	ATTA	2	8	2989	2996	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
136	NC_008513	T	6	6	2997	3002	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
137	NC_008513	TCT	2	6	3061	3066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	116514952
138	NC_008513	TTCC	2	8	3068	3075	0 %	50 %	0 %	50 %	116514952
139	NC_008513	C	6	6	3088	3093	0 %	0 %	0 %	100 %	116514952
140	NC_008513	AT	3	6	3115	3120	50 %	50 %	0 %	0 %	116514952
141	NC_008513	T	6	6	3194	3199	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
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151	NC_008513	T	17	17	3632	3648	0 %	100 %	0 %	0 %	116514952
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482	NC_008513	A	6	6	10738	10743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
483	NC_008513	ATT	2	6	10746	10751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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